正式名称はEMBOSS Explorerだったそうな。てっきりEMBOSS GUIかと思っていました。いやだってURLが...とか言い訳しないように > 自分 http://embossgui.sourceforge.net/ ちなみにDBCLSでのミラーはこちら: http://emboss.dbcls.jp/ むむ。日本語化されてる…

http://emboss.sourceforge.net/apps/release/6.0/emboss/apps/jaspscan.html EMBOSS-6系には、jaspscanなるものがあるらしひ。jaspextract、っていうのを使ってデータをセットしておけば、matrixにはIDでアクセスでき、matrix scanがとってもお手軽。

http://lists.sourceforge.jp/mailman/archives/jambo-users/2005/000034.html

http://jambo.sourceforge.jp/index?AdminGuide ぼちぼち、ダブルチェックが進んでます。マジで3章は長いよ。

http://lists.sourceforge.jp/mailman/archives/jambo-users/2005/000020.html 参加者募集中。

http://jambo.sourceforge.jp/index.php?%5B%5BEMBOSS%CB%DD%CC%F5%A5%D7%A5%ED%A5%B8%A5%A7%A5%AF%A5%C8%5D%5D わーい :-) あとはSequence Databasesか...ごほ、ごほ。

ftp://genome.dkfz-heidelberg.de/pub/emboss/perl/ というPerlライブラリがあるのを知る。メモ。

http://itoshi.tv/d/?date=20040525#p01 ナルホド。メモメモ。dbifastaやってから、emboss.defaultを次のようにするのだとか。 DB ENSMUST [ type: N format: fasta method: emblcd dbalias: ensmust directory: /sw/share/EMBOSS/data comment: "Ensembl Mo…

http://itoshi.tv/d/?date=20040413#p02 ここんとこBio::DB::GFFでコト足りてたんですが、このヘンが簡単にできると痒いところに手が届きます。何気にタイムリー。Thanks! % splitter 1.fa -size 10000 -overlap 1000 -outseq 1.splited.fa ちょっと思ったん…

http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Software/EMBOSS/Doc/Develop/program.html http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Software/EMBOSS/Doc/Nucleus/embaln.html hoged氏訪問ネタ関連つづき。こんなのがあった。ドキュメント充実しすぎ :-)

http://transgenic.cats.st/jambo/index.php?AdminGuide スタートしたみたいです。前回関わりそこなったアナタ、ぜひ、章の担当に手を挙げてみては?

http://itoshi.tv/d/?date=20040309#p01 http://itoshi.tv/d/?date=20040309#p02 僕も、次やるべきは、オリジナルなコンテンツだと思います。KNOBは重要ですが、それ以上にKNOBの過程で得られたノウハウが非常に有意義なものだと想像します。僕がこんどEMBOS…