2004-04-01から1ヶ月間の記事一覧

EMBOSSの開発サイトが閉鎖!?

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Announcement: Closure of EMBOSS development site http://www.emboss.org/ http://tn.minidns.net/t/?date=20040422#p01 http://www.hgmp.mrc.ac.uk/About/Teams/bioinformatics.html http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Research/ なんてこった。グラント取りに失…

BioMart software has been affiliated with GMOD

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http://itoshi.tv/d/?date=20040421#p01 http://www.ebi.ac.uk/biomart/news.html http://www.gmod.org/ http://www.gmod.org/biomart.shtml 要は、gmodのウェブサイトにBioMartの説明ができてるよ、というのがニュースになるのかな? 意味がよくわからなかっ…

gbrowseのセキュリティー情報

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https://www.netsecurity.ne.jp/article/6/10939.html ちょっとしたはずみで、こんなページにぶちあたった。1.53以前には脆弱性があったのだとか。こんな報告もされてたとは、知らなかった。

OSI承認ライセンス 日本語参考訳

http://www.st.ryukoku.ac.jp/%7Ekjm/security/memo/2004/04.html#20040420__opensource http://www.itmedia.co.jp/news/articles/0404/19/news041.html http://opensource.jp/licenses/ おぉ。これは素晴しい。メモメモ。...ん! Academic Free Licenseって…

2バイト文字を含むテキストの、文字数を数える

http://210.138.43.10/~kasukawa/d/?date=20040417#p01 これ、お世話になりました。 % nkf -e motif.rd | wc -mlw 381 584 8901

アナログシンセを完全自作してみよう

etc

http://slashdot.jp/articles/04/04/19/0918208.shtml?topic=38 http://www.aleph.co.jp/~takeda/radio/homemadesynth.html メモメモ。

INSTRUCTIONS TO AUTHORS IN THE HEALTH SCIENCES

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http://210.138.43.10/~kasukawa/d/?date=20040419#p01 http://www.mco.edu/lib/instr/libinsta.html メモメモ。

手書きPDF入門

http://www.genome.ist.i.kyoto-u.ac.jp/~ichinose/memo/?date=20040419#p01 http://www.kobu.com/docs/pdf/pdfxhand.htm メモメモ。

新しい創傷治療

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http://slashdot.jp/comments.pl?sid=174192&cid=0&pid=0&startat=&threshold=1&mode=nested&commentsort=0&op=%CA%D1%B9%B9 http://www.asahi-net.or.jp/~kr2m-nti/wound/ http://www.asahi-net.or.jp/~kr2m-nti/wound/wound023.htm http://www.asahi-net.o…

BioTextUtils

etc

ってカテゴリを作ってみた。ちと長いか? http://itoshi.tv/d/?date=20040414#p03

MySQL Cluster

http://japan.linux.com/enterprise/04/04/15/057233.shtml?topic=1 メモメモ。

GD::Graphについての記事

http://japan.linux.com/desktop/04/04/15/0110216.shtml?topic=1 最近、このテのグラフは全部Rで描いたと思いこんでしまふ...

grep -c

http://catlover.myhome.cx/tdiary/?date=20040415 し、しらなかった...(汗)

人質解放

etc

本当に、よかった。 イラク関連newsは、ここにもまとまってます http://www.st.ryukoku.ac.jp/%7Ekjm/security/memo/2004/04.html#20040415__iraq

目についたところをちょろっと。

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Qing Zhou and Jun S. Liu, Modeling within-motif dependence for transcription factor binding site predictions, Bioinformatics 2004 20: 909-916. Ewan Birney et al. An Overview of Ensembl Genome Res. Published April 12, 2004, 10.1101/gr.18606…

GO for non-coding RNA

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http://210.138.43.10/~kasukawa/d/?date=20040414#p01 http://www.geneontology.org/email-go/go-arc/go-2002/0128.html ナルホド。そーゆーことなのですね。メモメモ。

sqlite

http://www.hwaci.com/sw/sqlite/ http://www.hwaci.com/sw/sqlite/datatypes.html http://www.net-newbie.com/sqlite/lang.html 実は、join等のコマンドがあまり得意じゃありません。ここ数日、便利さを実感してるのが、sqlite。以前、ngsmさんの日記で見た…

splitでハマった事例

http://itoshi.tv/d/?date=20040414#p03 splitは、ファイルを指定した長さで切るのにとっても便利。ハマることがあるので注意が必要。例えば、 % split -l 100 foo.txt とすると、foo.txtを100行毎に分割したxaa, xab, ...というファイルができる。xzzまでい…

染色体をてきとーに分割してMulti FASTAにする

http://itoshi.tv/d/?date=20040413#p02 ここんとこBio::DB::GFFでコト足りてたんですが、このヘンが簡単にできると痒いところに手が届きます。何気にタイムリー。Thanks! % splitter 1.fa -size 10000 -overlap 1000 -outseq 1.splited.fa ちょっと思ったん…

K-BROWSER

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http://hanuman.math.berkeley.edu/cgi-bin/kbrowser2 どこぞのデスクトップ環境のInternet Browserな響きがありますが、それとは全然関係のないゲノムブラウザ。UCSC genome browserベース。こーゆーヤツ、さすがにgbrowseベースはないのかな。

Sounds of FreeCulture

http://blog.japan.cnet.com/lessig/archives/001134.html http://www.turnstyle.org/FreeCulture/ http://akma.disseminary.org/archives/001253.html http://free-culture.org/ http://free-culture.org/remixes/ Lessigさんの著書、FreeCulture (ISBN:159…

rootkit hunter

http://japan.linux.com/security/04/04/11/1158228.shtml?topic=1 http://www.rootkit.nl/ http://build.lnx-bbc.org/packages/utils/chkrootkit.html 今は、公開サーバ運用なんて面倒くさいことはやってないけど、まぁリテラシーとして覚えとく。chkrootki…

elecomルータがGPL違反?

http://slashdot.jp/security/04/04/04/1740234.shtml 見落としてた。メモメモ。

zphoto0.8

http://namazu.org/~satoru/diary/20040404.html#p01 http://namazu.org/~satoru/zphoto/ http://namazu.org/~satoru/zphoto/zphoto-w32-0.8.zip みんな大好きzphotoが、windowsでも動くようになったそうです。zphotoで遊ぶ人口が、一気に増えそうな予感(希…

で、User Mode Linux

kernel 2.6.xのホストで動くことを確認。ちゃんとフツーに最新パッチをあててコンパイルするだけでOK。実は、凝った設定は必要なかった。ただ、ディストリビューションのイメージと違うカーネルを使用するので、モジュールを突っこんでやる点を忘れないよう…

金田のバイク

etc

バイクに興味はないけど、このバイクはすげぇ欲しい。いや、さすがに買わないけどね。AKIRAサイコー。 http://slashdot.jp/articles/04/04/06/010214.shtml?topic=9 http://www.itmedia.co.jp/lifestyle/articles/0404/02/news040.html http://www.neo-fukuo…

She wants to move / N.A.R.D

etc

センス良すぎな曲。何回聞いても、燃え(萌え?)る。巷ではめちゃめちゃ流行ってるみたいなので、こんなところで紹介するのもアレだけど、たまには はてなに貢献してみるテスト。ただ、このシングルカット以外の曲は、どってことないのでがっかりしないように…