coreutilsのshufで行単位のサンプリング

http://d.hatena.ne.jp/echizen_tm/touch/20100428/1272477184 久しぶりのメモ。

ほぼ日刊イトイ新聞 - クロネコヤマトのDNA

http://www.1101.com/yamato/index.html クロネコ社長のインタビュー。たいへん示唆にとんでいるので、ぜひ最初から読んだ方が良い。復興関連などもたいへん興味深いことがいくつもあるけど、ココロに残った部分をメモ。道を知っているからです - あたりまえ…

使命、計画書、そして戦略

"善意で山は動かない。山を動かすのはブルドーザーである。使命と計画書は善意に過ぎない。戦略がブルドーザーである。戦略が山を動かす。" https://twitter.com/druckerbot/status/113930009730752512

データ化

"データ化できないものを考えなければならない。データ化できないものについての配慮を忘れたデータ化は、組織を間違った方向へ導く。"https://twitter.com/druckerbot/status/112420049968566272

PLoS oneは、ベータ版じゃなくなってた

bio

http://en.wikipedia.org/wiki/PLoS_ONE そういや2006のスタート時点ではベータ版だったよな…と思っていたら、2008年でもうベータじゃなくなってたそうな。

trello

http://techwave.jp/lite/archives/51699724.html https://trello.com/ めも。

WebGL脆弱性への対応状況

http://d.hatena.ne.jp/atsushieno/touch/20110511/p1 http://d.hatena.ne.jp/atsushieno/touch/20110511/p1 https://www.khronos.org/webgl/public-mailing-list/archives/1106/msg00042.html ブラウザの最近のstable ver.ではWebGLが、offになってることが…

旧型サーバを最新エコサーバにリプレースして、節電目標を楽々クリア!

http://ottoserver.com/pcserver1/wp/archives/251 宣伝とはいえ、good job!

ピチカートな小西さんの印象深いコメント

http://www.readymade.co.jp/journal/?p=2004 震災についてのコメントが、たいへん印象深い。真摯に。 かりそめにも平穏であった自分たちの暮らしの上に作っていたこのアルバムが、果たしてこの価値観のすっかり変わってしまった日本において、あるいは世界…

jksrcのURL

http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/ いつも見失うので、再度メモ。 ちなみに、bigWigMergeが現れた。 http://genomewiki.ucsc.edu/index.php/Genome_Browser_Software_Features#4_April.2C_2011_v249

ドラッカー語録

https://twitter.com/druckerbot/status/61071953133436928 問題に対しては、つねに行動をとらなければならないという考えそのものが、迷信にすぎない。 https://twitter.com/druckerbot/status/61164060795871232 (成果のあがらない理由)急ごうとする。そ…

22 free tools for data visualization & analysis: Data cleaning, stats, infoviz, GIS/maps, time-series, word clouds

http://www.computerworld.com/s/article/print/9215504/22_free_tools_for_data_visualization_and_analysis?taxonomyName=Applications&taxonomyId=18 JavaScript InfoVis toolkitも面白そう。メモ。

Wikipedia のサイズ

で、wikipediaを本格的にミラーしようとすると、数T必要だそうな。スゴ。 http://meta.wikimedia.org/wiki/Mirroring_Wikimedia_project_XML_dumps http://meta.wikimedia.org/wiki/Data_dumps http://ja.m.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:データベースダウン…

mediawikiと、他のwikiエンジン

いままで、hikiとかqwikiとかtracとかdocuwikiとか、いろいろ使ってきたけれど、結局、キャズムを超えられたのは、mediawikiだけなんじゃないだろうか、という気がする。ヒトに勧めて使いはじめてくれるまでの閾が低いイメージ。もちろん、プロジェクトに依…

mediawikiまわり

http://en.m.wikipedia.org/wiki/DBpedia semantic-mediawiki.org/ http://www.semantic-search.info/ 最後のリンクは結構面白い。

linked data / semanticweb/ rdfなマッシュアップへのsuggestion

http://lifesciencedb.g.hatena.ne.jp/nakao_mitsuteru/20091118/chap10 http://www.orally.co.jp/books/9784873114521/ https://twitter.com/32nm/status/52903495208148992 まずはidをURIで表現して、key-value をpredicateとobjectにすると、とりあえず何…

地震のスパコンへの影響、amazonの使い方

http://d.tnose.net/?p=1914 http://shuns.sblo.jp/pages/user/iphone/article?article_id=44015873

jksrc / hg18のENCODE regulation trackの設定

src/hg/makeDb/trackDb/human/hg18/trackDb.wgEncode.ra より、かいつまんでみる。 top levelは、superTrack (wgEncodeReg) 2nd levelは、container multiWig (wgEncodeRegTxn, wgEncodeRegMarkEnhH3k4me1, ...) 3rd levelにフツーのwig。 track wgEncodeReg…

jksrc / ucsc でのトラックグループ

http://genomewiki.ucsc.edu/index.php/Local_tracks_at_mirror_sites hg.confに db.grp=grp_lab,grp と書く。

jksrc / hgBbiDbLink / bigBedやbigWigファイルをloadする

src/hg/makeDb/trackDb/READMEより。 The database loading procedure is hgBbiDbLink hg19 myLocalBigWig /gbdb/hg18/bbi/myLocalBigWig.bw which is equivalent to: hgsql hg19 -e 'drop table if exists myLocalBigWig; \ create table myLocalBigWig (fi…

jksrc / trackDB.ra / Container tracks

とかいいながら、compositeと同じようにグルーピングするスキームとして、'container'というのがある。aggregateできる、ということらしいので、最近ENCODE regulation track用に追加されたコンセプトなのかもしれない。 Container tracks are yet another w…

jksrc / trackDB.ra / compositeTrack

トラックをグルーピングしたものを、COMPOSITE TRACKS, グルーピングされている各々のトラックをsubtrack、と呼ぶ。たとえば、vegaGeneの定義 in ./src/hg/makeDb/trackDb/human/hg19/trackDb.ra track vegaGeneComposite compositeTrack on shortLabel Vega…

jksrc / trackDB.ra / include

./src/hg/makeDb/trackDb/human/hg18/trackDb.ra の中で include trackDb.encode.ra なんてこともできる

jksrc / trackDb ドキュメント

src/product/README.trackDb src/hg/makeDb/trackDb/README メモ。

SVGの編集ができるLibreOffice 3.3

http://www.documentfoundation.org/ http://www.itmedia.co.jp/news/articles/1101/27/news016.html http://gihyo.jp/lifestyle/column/newyear/2011/openoffice-prospect http://slashdot.jp/it/11/01/29/239249.shtml いやー、時代は進む。SVGの編集がdra…

Google refine

http://code.google.com/p/google-refine/ せっかくn氏に教えてもらったのに、メモっていなかったので急いでメモる。

Google Body

http://bodybrowser.googlelabs.com/ http://www.googlelabs.com/show_details?app_key=agtnbGFiczIwLXd3d3IVCxIMTGFic0FwcE1vZGVsGJm1uQIM わぉ! http://www.gadgetpaper.com/google-body-browser-review-features-and-how-to-guide/ http://www.wonderhow…

Mac上でjksrcのビルド

http://d.hatena.ne.jp/kwg/20090805/p1 配布されているバイナリではbigWig over httpsができなかったので、久しぶりにビルドを試みる。USE_SSL=1としないとSSLとリンクしてくれない、とか若干だけ勝手がかわっているのでメモ。 export MYSQLINC="/opt/local…

Wikipediaの裏側 

http://gigazine.net/news/20101105_wikipedia_server/ あれれ...? lighttpdじゃなくってapacheなの? そんでもって、Squidキャッシング、なのだとか。 http://www.lighttpd.net/ そんでもって、ロードバランサはLVS-DR、Linux Virtual Server Direct Routing…

Google Books Ngram Viewer

http://ngrams.googlelabs.com/ 知らなかった。メモ。