http://d.hatena.ne.jp/echizen_tm/touch/20100428/1272477184 久しぶりのメモ。

http://d.hatena.ne.jp/atsushieno/touch/20110511/p1 http://d.hatena.ne.jp/atsushieno/touch/20110511/p1 https://www.khronos.org/webgl/public-mailing-list/archives/1106/msg00042.html ブラウザの最近のstable ver.ではWebGLが、offになってることが…

http://ottoserver.com/pcserver1/wp/archives/251 宣伝とはいえ、good job!

http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/ いつも見失うので、再度メモ。 ちなみに、bigWigMergeが現れた。 http://genomewiki.ucsc.edu/index.php/Genome_Browser_Software_Features#4_April.2C_2011_v249

http://www.computerworld.com/s/article/print/9215504/22_free_tools_for_data_visualization_and_analysis?taxonomyName=Applications&taxonomyId=18 JavaScript InfoVis toolkitも面白そう。メモ。

で、wikipediaを本格的にミラーしようとすると、数T必要だそうな。スゴ。 http://meta.wikimedia.org/wiki/Mirroring_Wikimedia_project_XML_dumps http://meta.wikimedia.org/wiki/Data_dumps http://ja.m.wikipedia.org/wiki/Wikipedia:データベースダウン…

いままで、hikiとかqwikiとかtracとかdocuwikiとか、いろいろ使ってきたけれど、結局、キャズムを超えられたのは、mediawikiだけなんじゃないだろうか、という気がする。ヒトに勧めて使いはじめてくれるまでの閾が低いイメージ。もちろん、プロジェクトに依…

http://en.m.wikipedia.org/wiki/DBpedia semantic-mediawiki.org/ http://www.semantic-search.info/ 最後のリンクは結構面白い。

http://lifesciencedb.g.hatena.ne.jp/nakao_mitsuteru/20091118/chap10 http://www.orally.co.jp/books/9784873114521/ https://twitter.com/32nm/status/52903495208148992 まずはidをURIで表現して、key-value をpredicateとobjectにすると、とりあえず何…

http://d.tnose.net/?p=1914 http://shuns.sblo.jp/pages/user/iphone/article?article_id=44015873

src/hg/makeDb/trackDb/human/hg18/trackDb.wgEncode.ra より、かいつまんでみる。 top levelは、superTrack (wgEncodeReg) 2nd levelは、container multiWig (wgEncodeRegTxn, wgEncodeRegMarkEnhH3k4me1, ...) 3rd levelにフツーのwig。 track wgEncodeReg…

http://genomewiki.ucsc.edu/index.php/Local_tracks_at_mirror_sites hg.confに db.grp=grp_lab,grp と書く。

src/hg/makeDb/trackDb/READMEより。 The database loading procedure is hgBbiDbLink hg19 myLocalBigWig /gbdb/hg18/bbi/myLocalBigWig.bw which is equivalent to: hgsql hg19 -e 'drop table if exists myLocalBigWig; \ create table myLocalBigWig (fi…

とかいいながら、compositeと同じようにグルーピングするスキームとして、'container'というのがある。aggregateできる、ということらしいので、最近ENCODE regulation track用に追加されたコンセプトなのかもしれない。 Container tracks are yet another w…

トラックをグルーピングしたものを、COMPOSITE TRACKS, グルーピングされている各々のトラックをsubtrack、と呼ぶ。たとえば、vegaGeneの定義 in ./src/hg/makeDb/trackDb/human/hg19/trackDb.ra track vegaGeneComposite compositeTrack on shortLabel Vega…

./src/hg/makeDb/trackDb/human/hg18/trackDb.ra の中で include trackDb.encode.ra なんてこともできる

src/product/README.trackDb src/hg/makeDb/trackDb/README メモ。

http://www.documentfoundation.org/ http://www.itmedia.co.jp/news/articles/1101/27/news016.html http://gihyo.jp/lifestyle/column/newyear/2011/openoffice-prospect http://slashdot.jp/it/11/01/29/239249.shtml いやー、時代は進む。SVGの編集がdra…

http://code.google.com/p/google-refine/ せっかくn氏に教えてもらったのに、メモっていなかったので急いでメモる。

http://bodybrowser.googlelabs.com/ http://www.googlelabs.com/show_details?app_key=agtnbGFiczIwLXd3d3IVCxIMTGFic0FwcE1vZGVsGJm1uQIM わぉ！ http://www.gadgetpaper.com/google-body-browser-review-features-and-how-to-guide/ http://www.wonderhow…

http://d.hatena.ne.jp/kwg/20090805/p1 配布されているバイナリではbigWig over httpsができなかったので、久しぶりにビルドを試みる。USE_SSL=1としないとSSLとリンクしてくれない、とか若干だけ勝手がかわっているのでメモ。 export MYSQLINC="/opt/local…

http://gigazine.net/news/20101105_wikipedia_server/ あれれ...? lighttpdじゃなくってapacheなの？ そんでもって、Squidキャッシング、なのだとか。 http://www.lighttpd.net/ そんでもって、ロードバランサはLVS-DR、Linux Virtual Server Direct Routing…

http://ngrams.googlelabs.com/ 知らなかった。メモ。

http://www.microsoft.com/japan/mac http://journal.mycom.co.jp/articles/2010/10/27/ofm01/index.html Macに移行したときの(数少ない)不満の一つに、excelの未完成度があったのだけれど、Office2011でかなり改善されてる。数式バーがリーズナブルなところ…

3hもかけていろいろアクセスして大変に疲れました。その中で記憶に残るDBを。 http://omics.tmd.ac.jp/icod_pub_eng/portal/top.do 症例をかなり詳細まで見ることができるのが大変参考になる。 http://www.genome.jp/kusuri/ http://www.japic.or.jp/index.h…

http://frugaltheme.com/ らくちんそう。買わなきゃいけないけど。

http://www.ploscompbiol.org/article/info:doi/10.1371/journal.pcbi.1000941 でたぁ PloS Comput BiolのTen Simple Rules。Alex Batemanといえば、DB issueなヒトはお世話になったことを覚えているでしょうが（ちなみに、今は違うヒトがeditor）、今はWiki…

renameがosx上に欲しいよ！macportsにはみあたらないので、直コンパイル http://mywiki.jp/mememe/Mac+OS+X+Hacking/%8F%AC%83l%83%5E%83%81%83%82/history/ の手順: tarballを入手 http://www.kernel.org/pub/linux/utils/util-linux/ 展開 とりあえず./con…

あと、データ転送速度の事を考えにいれたら容量無制限かどうかなんてのは実質意味がないことも覚えておいたほうがいい。何テラバイトもバックアップしたってどうせ意味のある時間内には手元にリストアできないのだ。 http://push-button-pub.blogspot.com/20…

http://computerbecamecloud.blogspot.com/2010/02/cloud-storage1.html http://computerbecamecloud.blogspot.com/2010/02/zumodrivedropbox-cloud-storage2.html http://computerbecamecloud.blogspot.com/2010/02/dropboxzumodrive-zumodrivehp1hpnetbook…