2004-03-01から1ヶ月間の記事一覧

貼ってみるテストのつづき

BioMail home page: http://biomail.sourceforge.net/biomail/index.html PubMed home page: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 1: Keskin O, Tsai CJ, Wolfson H, Nussinov R http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&lis…

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はてなでトラックバックの送信が(ややこしいことしなくても)できるようになったっぽい。編集画面から。おっと。ここに告知が。 http://d.hatena.ne.jp/hatenadiary/20040325#1080189658 http://d.hatena.ne.jp/hatenadiary/20040325#1080199983

user mode linux on kernel 2.6

http://usermodelinux.org/modules.php?name=News&file=article&sid=142 --- 1.5/arch/um/os-Linux/process.c Sat Jan 18 12:29:27 2003 +++ 1.6/arch/um/os-Linux/process.c Thu Oct 2 14:27:57 2003 @@ -7,6 +7,7 @@ #include #include #include + #includ…

アット・ザ・ヘルム

bio

http://dnamicroarray.org/t/20040330.html#p04 http://www.medsi.co.jp/2001_2500/2263.html 目次を見ましたが、すごい内容みたいですね。とっても興味深い。ジャンルが違うとしても、通じるところはあるんだろうな。「権力は持ちたくないし持たれたくもな…

gbrowseがついに

bio

http://www.gmod.org/ DASに対応してたみたい。素晴らしい。1.58までしか触ったことが無かったんだけど、1.59からDASに対応した、とのこと。ただし、完全にサポートされているわけではなく、DASのsourceが1個しか選べない(未確認)とことか、GUIで指定できる…

貼ってみるテスト

BioMail home page: http://biomail.sourceforge.net/biomail/index.html PubMed home page: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 1: Staib P, Binder A, Kretschmar M, Nichterlein T, Schroppel K, Morschhauser J http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/qu…

RECOMB/Regulatory Genomics

bio

http://recomb04.sdsc.edu/ http://www.cs.ucsd.edu/%7Eeeskin/recombreg04/ また続き。こんなsatelliteあったんですね。知りませんでした。メモメモ。

tissue specificなハナシ

bio

Xu, Qiang, Modrek, Barmak, Lee, Christopher, Genome-wide detection of tissue-specific alternative splicing in the human transcriptome Nucl. Acids. Res. 2002 30: 3754-3766 http://nar.oupjournals.org/cgi/content/full/30/17/3754 またまたhoged…

EMBOSSのライブラリを使ったプログラム開発するには

http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Software/EMBOSS/Doc/Develop/program.html http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Software/EMBOSS/Doc/Nucleus/embaln.html hoged氏訪問ネタ関連つづき。こんなのがあった。ドキュメント充実しすぎ :-)

Bioinformatics誌 スタイルファイル

bio

http://www.iscb.org/ismb2003/paper_format.shtml http://www.iscb.org/ismb2003/tex-template.tar hoged氏訪問成果の一つ。ネタとしては聞いたことはあったんだけど、ありかまで教えてもらってしまった。たのしすぎ。:-)

hoged氏訪問

bio

久し振りに、大学の研究室らしい雰囲気を味わう。なつかしーな。でも、段違いにキレイで恵まれた環境。Rとか、GFF/gbrowseとか、DBXXXな話とか、論文の話とか。とても参考になり、楽しませていただきました。忙しいところ、相手してくださってありがとうござ…

free cluture

http://slashdot.jp/books/04/03/25/2040256.shtml?topic=102 http://slashdot.jp/comments.pl?sid=168392&cid=521424 http://cruel.org/candybox/freeculturej.pdf CCライセンスで公開された、レッシグ先生の新刊。3つめのリンクでは、「はじめに」の日本語…

perl

http://maid.sytes.net/~mugetu/diary/?date=20021127#p01 より。なんだか、見たことのないエラーだったので調べたらこういうことみたい。 標準インストールでは、Perlを実行するたびに警告がでる。 |perl: warning: Setting locale failed. |perl: warning:…

O先生&i博士

bio

i博士の学位記を拝見。おめでとうございます。そういや御二方からアレ本の話が出なかった :-)

backports

http://www.backports.org/ こりゃイケるかも。

Serial ATA関連

http://www.linuxmafia.com/faq/Hardware/sata.html http://oregonstate.edu/~kveton/debian/ http://public.www.planetmirror.com/pub/debian-netinst/kveton/

カーネル再構築などなど

http://www.irori.org/doc/woody-2.6.html http://web.sfc.keio.ac.jp/~s95898ym/comp/debian-kernel-upgrade.html http://homepage3.nifty.com/shinchandesu/linux/kernel-2.6.0.html http://park15.wakwak.com/~unixlife/linux/de-kernel.html http://park…

biomail

いくつか登録してたのが来たけど、思ったほどの量にはならなかった。参考までに。 Search string: algorithm and clustering and (protein or expression) Searched database: Pubmed Frequency: Twice per week Maximum references: 50 Items found: 0 あり…

sidはunstable

なんだとか。一応、upgradeの手順をメモ http://www.aisasystem.co.jp/~sakurai/admin/diary0112.html /etc/apt/sources.list中のwoodyの部分をsidに変更して、 #apt-get update #apt-get dist-upgrade cpan2rpmみたく使えるものはないのかな。DPKG-Toolsは…

ランレベル

http://park15.wakwak.com/~unixlife/linux/de-init.html 少なくともRedHat系とは違う。メモメモ。

biomail

bio

http://d.hatena.ne.jp/kwg/20030923#p5 http://biomail.sourceforge.net/biomail/ http://www.biomail.org サービスもしてたんだ。気が向いたので登録してみた。

debianな日々

スタート。久し振りにlilo見た。つい、rpm -qとか叩いてる自分がいる... インストールでは、debianの凄さを堪能。やっぱすげえな、コイツら。とか言いながら、Xの設定でつまづいてみた。googleさんによると、こんなページを参考にせよ、とのこと。 http://de…

calenderモジュール

つけてみた。これ見て、意外にマメに更新してる自分にびっくり。

一段落したので

etc

ずっと言ってたのに行けてなかったhogedさんのところに遊びにいけるかな、とおもったら...そうか、今は京都なんですね。計画性まるでなし > 自分。

finishing作業

bio

とりあえず、自分的には終了。

来週のたのしみ

bio

http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/nrg/journal/v5/n3/full/nrg1295_fs.html http://info.nature.com/cgi-bin24/DM/y/eOOC0BhwsC0Ch0JHM0Ab http://info.nature.com/cgi-bin24/DM/y/eOOC0BhwsC0Ch0JHa0Av http://www.natureasia.com/campaig…

tdiaryplot, tdiarychart

http://namazu.org/~satoru/diary/20040318.html#p01 http://namazu.org/~satoru/attic/tdiaryplot http://www.commentout.com/people/takai/doc/hiki.cgi?tdiarychart.rb tdiaryな方たちのために。

MySQL auto-backup utility, gmod-devel

http://dnamicroarray.org/t/20040318.html#p03 http://sourceforge.net/projects/automysqlbackup/ https://lists.sourceforge.net/lists/listinfo/gmod-devel メモメモ。ついでに入ってなかった(オイ)gmod-devel MLにも入ってみる。ちなみに、こうやってリ…

KNOPPIXカスタマイズサービス

http://slashdot.jp/articles/04/03/16/1810222.shtml?topic=46 http://www.alpha.co.jp/knoppix/ 面白い。問題は、ちゃんと商売として成立するかどうか、あるいはさせられるかどうか。期待をこめてwatch。ついでにこれもメモ http://japan.linux.com/enterp…

Biomart

bio

http://itoshi.tv/d/?date=20040317#p02 http://www.ebi.ac.uk/biomart おぉ。恥ずかしながら、初耳だった。来週になってから、じっくり眺めよう。メモメモ。ところで、gbrowseの論文とか、この種のDBスキーマ、何か書くツールがあったりします? http://www.…