2004-01-01から1年間の記事一覧

昔の話って

etc

記憶力の悪い僕には、思いだすだけでも一苦労。

GNU make の暗黙ルール/型ルールの使用例

やっぱ、GNU makeはすげー。やばすぎ。 $ cat Makefile %.tab: %.csv cat $perl -pwe 's/,/\t/g' > $@ from = $(wildcard *.csv) into = $(patsubst %.csv,%.tab,$(from)) target: $(into) $ ls Makefile bar.csv foo.csv $ make cat bar.csv | perl -pwe 's…

明日から

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かずさに行きたかったけど、個人的な都合で、ちと断念。

from HTML into LaTex

http://d.hatena.ne.jp/kwg/20040309#p3 ここにLaTeXのラッパーとして、RDとか書いてましたが、htmlからLaTeXのコードへ変換するスクリプトが結構、公開されてたんですね。知らなかった。これさえあれば、 RD -> html -> latex EmacsWiki -> html -> latex …

Rでラベルの向きを変更する

http://www.okada.jp.org/RWiki/?R%A4%CE%A5%B0%A5%E9%A5%D5%A5%A3%A5%C3%A5%AF%A5%B9%A5%D1%A5%E9%A5%E1%A1%BC%A5%BF#content_1_40 par(las={0,1,2,3}) 結構、探した。ようやく、ベクトルとかの扱いに馴れてきたとこだけど、図のパラメータはこれから。やっ…

DAG-editがOBO-editに

Once the latest beta is approved, DAG-Edit 1.419 will become an official release. After version 1.419, I'm pleased to announce that DAG-Edit will receive a new name: OBO-Edit gofriends MLより

るびま(rubyist magazine)

http://groups.yahoo.co.jp/group/bioinformatics-jp/message/2508 http://jp.rubyist.net/magazine/ メモメモ

Creative Commonsライセンスな教材

http://creativecommons.jp/isession/index.php?itemid=94 http://www.jkokuryo.com/class/nsociety2004/ http://case.sfc.keio.ac.jp/license.html 結構、好感が持てる形ですね。ありがちな「academic free」とか「非商用の利用のみ可」しか言わずに公開す…

Reactome - a knowledgebase of biological processes

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http://www.genomeknowledge.org/ こないだ探してて、見付けるのにちょっと手間取ったので、メモしておく。今はversion10になってるらしい。

タンパク質構造百科辞典

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http://dnamicroarray.org/t/20041011.html#p03 http://eprots.protein.osaka-u.ac.jp/eProtS/Top.jsp これ、すごいなぁ。すばらしい。出が生物屋さんでないbioinformatics屋さんなんかは、生物の知識、とくに分子生物学の知識をいきあたりばったりに吸収す…

R-2.0.0 リリース

http://tn.minidns.net/t/?date=20041005#p01 http://dnamicroarray.org/t/20041005.html#p02 https://stat.ethz.ch/pipermail/r-announce/2004/000792.html http://cran.r-project.org/src/base/R-2/R-2.0.0.tar.gz 結構、ドラスティックに変ってるっぽいで…

GFF3

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http://210.138.43.10/~kasukawa/d/?date=20041005#p01 http://song.sourceforge.net/gff3.shtml GFF3のRC2とrelease versionの違いに関するすばらしいまとめ。

やっと10月に入ったのに

etc

仕事が減る気配が無いのは、どういうこったい。ちっとは、こっちの話も、進めさせてくれぇ。

某校正

etc

きてました。ついに、順番が入れ換わった〜 :-)

firefox 1.0PRのキーバインド

http://slashdot.jp/comments.pl?sid=213892&cid=631208 http://slashdot.jp/comments.pl?sid=213892&cid=631212 まったく同じことをやって、同じことを感じているヒトがいた。firefoxのキーバインドを(0.9以前のように)emacs風にするには GTK2版を使ってる…

イチロー、大リーグ新記録

etc

http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20041003-00000000-san-spo http://dnamicroarray.org/t/20041003.html#p04 野球は、ビール飲みもって見るよりplayした方が楽しい、と思ってる僕でさえグっとくるできごとでした。bonohuさんの引用されている言葉には、新…

Cortel氏、参戦!

http://jambo.sourceforge.jp/index.php?%5B%5BEMBOSS%CB%DD%CC%F5%A5%D7%A5%ED%A5%B8%A5%A7%A5%AF%A5%C8%5D%5D わーい :-) あとはSequence Databasesか...ごほ、ごほ。

emacs-wikiの設定 (for xemacs)

http://repose.cx/emacs/wiki/emacs-wiki.el.gz これを使っていてもいいが、結構古いことにようやく気付く。現在のメンテナは、sachaさん。projectの利用を開始するにあたって、sachaさんの版へ移行。1. 下記あたりから、sacha-stableをdownload。とりあえず…

はてなダイアリーへトラックバックを送る

はてな外部のヒトには探すのが難しいと思うので、ここにも貼っておきます。 http://dnamicroarray.org/t/20040925.html#p04 http://d.hatena.ne.jp/keyword/%a4%cf%a4%c6%a4%ca%a5%c0%a5%a4%a5%a2%a5%ea%a1%bcTrackBack%a5%b7%a5%b9%a5%c6%a5%e0?kid=3153#p3…

Blog Hacks に寄稿した小ネタ集

http://www.namazu.org/~satoru/diary/20040918.html#p01 http://namazu.org/~satoru/pub/bloghacks/ asamasidのネーミングセンスが楽しい :-) 気になるのは、やっぱりblogplotかな。

tdiary へのコメントspamを一括削除

http://www.namazu.org/~satoru/diary/20040923.html#p01 自分でtdiaryをメンテナンスされてる方に朗報です。そのうち、tdiaryのcontribにも入る予定とか。

CreativeCommons な Genome Biology の article

http://hoged.tdiary.net/20040915.html#p05 そうだったのですね。すばらしい。そういやPLoSに代表される最近のopen-accessなpaperのライセンスって、どうなってるんだろ...と思って、とりあえずPLoSを調べてみたところ、こちらもやはり、Creative Commonsら…

えぇ?

etc

http://hoged.tdiary.net/20040923.html#p04 な、なにを...? 身の振り方を考えてる僕としては、とっても気になります。

bioFOX

http://itoshi.tv/d/?date=20040917#p01 http://bioinfo-goto.seesaa.net/article/612037.html http://schematron.unl.edu/biofox/ こりゃスゲェ

より自由なspotfireへ。

bio

http://itoshi.tv/d/?date=20040922#p01 いいアイデアですね。ただ使ったことがないので、本当にmysqlライクなビジネスでうまくまわるか、何ともいえませんが。ただ、今のライセンスじゃ当面、僕も使ってみることができないと思うし、そうできないと、どんな…

あと、1週間で9月も終了

etc

いやしかし、今月は山場がいくつもあってたまらん。あと、もう一息。

びっくり。

etc

http://www.jsbi.org/news/newsletter09.pdf そこまでちゃんと読んでらっしゃるなんて... :-)

RからSQLiteを使う

http://www.okada.jp.org/RWiki/?SQLite

exonerateのコンパイル

http://210.138.43.10/~kasukawa/d/?date=20040901#p01 今、最もアツい(ほんとか)exonerate。nerサイコー。それはともかく、glilbのコンパイルがやっかいなだけに、この手順はうれしい! バックアップを兼ねて、ここにもミラー。 1. glib-1.2.10を展開する 2.…

いきなり、まわってきた...

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皆様、差し支えなければ、ご協力下さい。詳細は、後程。