ontlogies for genomic coordinates

bio comp 
http://sswapmeet.sswap.info/map/map.owl
http://sswapmeet.sswap.info/map/units
http://sswapmeet.sswap.info/map/startPosition
http://sswapmeet.sswap.info/map/endPosition
http://sswapmeet.sswap.info/map/chromosomeNumber

SemanticWeb/RDFなスタイルでゲノム座標系を表す述語としては、これでいいのかな？結局、ウチの近くでsemanticWebやっているヒトたちに聞いてもでてこなくって一ヶ月経過。そんなこんなしているうちに、さっき、たまたまコレをみつけた。上記の定義でもまだ不明確なのは、

  • GFF styleとBED styleな座標系を、どう分けて記述するの?
  • strandは？
  • Genome assemblyは?
  • ENSEMBL StyleとUCSC Styleな染色体識別子は、どう分けて記述するの？ (1,2,...かchr1, chr2,...)

うーん、めんどくさすぎる。現場にいるヒトは誰もまともに使っていない、という認識でいいのかしらん? オレ、定義しちゃってもいいかね?