2003-07-12から1日間の記事一覧

biolinux.orgのbioperlパッケージ

bio

specファイルを見たら、凄いことになってました(いや、そのweb pageにちゃんとかいてあったんだけど)。いっこのパッケージに、bioperl, GD, XML-Writer, AcePerl, libgd, ...etc.を含んでいる模様。いや、もちろん、そういうポリシーもアリだと思うけど、で…

cpan2rpm

kasuchanより。"perl -MCPAN -e shell"としてインストールする感じで、rpmをつくってくれる。パッケージ関係は、(アンインストールとかも考えると)できればrpmで管理したいなぁ、と思っている僕には、とっても重宝なブツ。

fastaのバージョンアップ

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反応が遅いですが。Hogedさんより。メモメモ。 (1)formatdb version 4 データベースの読み込みと、 (2)PSI-Blast のプロファイルを SSEARCH で利用できる ようになったそうです。すごい。でも、(1)に対応しても、アルゴリズムがいっしょだったら、たぶん、…