HDF5
http://en.wikipedia.org/wiki/Hierarchical_Data_Format http://www.hdfgroup.org/HDF5/index.html
科学技術計算用のファイルフォーマット、らしい。SRFとかと同じレベルのフォーマットなのかしらん。
Python APIなPyTablesに、HintsForSQLUsersというドキュメントがあって、これをみるとなんとなくやりたいことがわかりそうな感じ。
http://www.pytables.org/moin/HintsForSQLUsers#Creatinganindex