exonerate
http://www.ebi.ac.uk/~guy/exonerate/ http://www.biomedcentral.com/1471-2105/6/31
久しぶりにENSEMBLを見て、exonerateを思い出した。見てみたら、論文が出ていたんですね。気づかなかったな。またぼちぼち眺めよう。
GeneRegulationView on ENSEMBL
http://bonohu.jp/t/20051006.html#p04 http://www.ensembl.org/Homo_sapiens/newsview?rel=34 [cisRED] http://www.cisred.org/ http://www.cisred.org/browse_databases http://www.cisred.org/content/methods/Presentations/CSHL_Biology_of_Genomes_May_2005.pdf [flyreg] http://www.flyreg.org/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=15572468&query_hl=2
おぉ。こーゆーviewが見たくなるのは人情でしょうか :-) やっぱり見たくなるよねぇ。で、利用されてるデータとしては、cisREDも悪くないんだろうけど、やっぱりflyregがimpressive。なんたって、'results of the systematic curation and genome annotation of 1,365 DNase I'だもん。